Featured image of post SPIRE与gcMeta:两大全球微生物组资源数据库

Introduction

生命世界由微生物主宰,它们驱动生物地球化学循环,作为动植物共生体支撑宏观生命,并代表了已知生命的绝大部分多样性。然而,绝大多数微生物多样性仍属“生物暗物质”:尽管宏基因组技术可直接从测序数据中研究微生物,但绝大多数微生物难以实验室培养,且微生物基因编码的功能空间仅有一小部分被表征。尽管测序数据呈指数增长,但主要微生物栖息地仍研究不足,几乎每个新测序的宏基因组都会增加“新”物种和数千个功能未知的“新”基因。

现有资源如QIITA、MGnify等主要聚焦于提供大型基因或基因组目录、功能与分类分析,或协调异构数据,但通常局限 …