微生物共现网络的推断常常面临准确性低和工具依赖性强的挑战。这里介绍了 microbetag,这是一个全面的软件生态系统,旨在对微生物网络进行功能注释。该工具对网络中的节点(代表分类单元)进行表型性状富集,并对边(代表物种关联)进行代谢互补性增强,从而揭示潜在的交叉喂养关系。microbetag 的在线版本依赖于 microbetagDB 数据库,该数据库包含了 34,608 个已注释的代表性基因组。此外,用户也可以通过其独立版本,利用自定义的基因组或宏基因组组装基因组对网络进行注释。为了便于使用,作者还开发了 MGG,一个 Cytoscape 应用程序,为网络的获取、可视化和分析提供了简化的用户友好界 …