Featured image of post metaTraits:微生物表型性状信息的大规模整合平台

微生物表型性状是理解其生态功能、生理特性及环境适应的关键,然而相关数据长期分散于多个数据库,且难以覆盖大量未培养微生物。有时候我们想知道一些微生物的表型形状如细胞形态(如形状、大小和革兰氏染色)、生理特性(如运动性和孢子形成)、代谢与酶活性、环境偏好(如温度、盐度和氧耐受性)以及生活方式类别等,需要手动查询并整理。

metaTraits作为一项统一的资源,整合了培养来源的性状数据与基因组预测结果,覆盖超过220万微生物基因组及140余种标准化性状,显著提升了微生物性状数据的可及性与互操作性。最近发表在了NAR上。</p …