Introduction
METabolic And BiogeOchemistry anaLyses In miCrobes (METABOLIC) 是一款基于微生物群的生物化学分析软件。该软件能够预测任何给定基因组数据集的代谢和生物地球化学功能性状特征。这些基因组数据集可以是宏基因组组装基因组 (MAG)、单细胞扩增基因组 (SAG) 或分离菌株测序基因组。
METABOLIC有两个主要实现，分别是METABOLIC-G和METABOLIC-C。 METABOLIC-G.pl 允许生成输入基因组的代谢谱和生物地球化学循环图，并且不需要输入测序读数。 METABOLIC-C.pl 生成与 METABOLIC-G.pl 相同的输出，但由于它允许输入宏基因组读取数据， …