Introduction
微生物组是一个动态变化的生态系统，其组成与功能会随时间推移受微生物间相互作用、宿主饮食、抗生素干预等因素影响。揭示这些动态变化规律，对理解肠道菌群稳态维持、疾病发生机制及干预策略设计至关重要。然而，传统研究方法面临诸多局限：要么无法捕捉时间维度上的因果关系，要么在处理高复杂度微生物网络时因参数爆炸导致模型难以解释，要么忽略测序数据中的噪声干扰，难以准确推断生态系统级的动态特征。
《Nature Microbiology》发表的研究 “Learning ecosystem-scale dynamics from microbiome data with MDSINE2” 提出了创新性解决方案。研究者开发的MDSINE2（Microbial Dynamical Systems Inference …