
Introduction
水平基因转移通过移动遗传元件在细菌物种间传播抗生素抗性基因,是临床耐药性扩散的重要机制。Ellabaan等人开发了一种两步预测方法:首先基于已知ARG-MGE对的基因组邻近性预测潜在的新宿主范围,然后利用SRA数据库中的原始测序数据验证预测结果。该研究报道了高达66%的验证率,包括多个跨门水平的ARG转移事件,如典型的葡萄球菌基因blaZ在肠杆菌科分离株中的检测。
然而,公共基因组数据库中普遍存在的污染问题可能严重影响此类预测研究的可靠性。随着测序数据量的快速增长, …