使用GenomeSPOT从氨基酸组成预测微生物生长条件

Introduction

微生物的生长条件（如盐度、pH值、氧气耐受性和温度）是理解其生态功能、代谢特性及应用潜力的关键，但传统实验测定方法耗时且难以覆盖海量未培养微生物。为此，Tyler P. Barnum等研究者开发了GenomeSPOT——一款基于基因组序列预测细菌和古菌生长条件的工具，并于2024年3月在预印本平台bioRxiv（doi: https://doi.org/10.1101/2024.03.22.586313 ）发表相关研究。

该工具通过对系统发育多样性微生物分离株的氨基酸组成数据训练统计模型，可快速预测目标微生 …