Featured image of post NCBI不维护?试试上传数据至ENA

Introduction

很早之前写了一个上传测序数据到ENA的小教程,但是用的人不多,大部分研究还是直接上传到NCBI,会自动同步到ENA。

但最近因为资金短缺,NCBI各种业务暂停维护,但大家投文章又很着急满足杂志社的数据公开政策,ENA就成了重要的一个选择(上传到国内的CNGB有些杂志和审稿人不认可,唉。。。),所以在此更新一下上传的步骤。

European Nucleotide Archive (ENA) 是一个由欧洲分子生物学实验室 (EMBL) 欧洲生物信息学研究所 (EBI) 维护的公共数据库。ENA 收集、存储和提供核酸序列数据,是全球生物学和生物信息学研究的重要资源之一。以下是 ENA 的几个关键点:

  1. 数据收集和存储:ENA 接收并存储来自全球各地的核酸序列数据。这些数据包括DNA和RNA的序列,以及相关的元数据,如序列的来源、 …