使用CRISPRCasTyper注释和分类CRISPR-Cas基因

Introduction

CRISPR-Cas系统是原核生物中广泛存在的适应性免疫系统，通过识别并切割入侵的噬菌体或质粒DNA/RNA，保护宿主免受外源遗传物质的侵害。自被开发为基因编辑工具以来，CRISPR-Cas系统的研究热度持续攀升，而其天然多样性更是为生物技术创新提供了丰富资源——不同类型的CRISPR-Cas系统（如Class 1的I型、III型，Class 2的II型、V型、VI型）具有独特的组成、作用机制和靶向偏好，例如Cas9（II型）适用于DNA编辑，Cas13（VI型）则针对RNA，Cas12（V型）具有 collateral cleavage活性。

然而，解析微生物基因组中的CRISPR-Cas系统面临两大核心挑战：

1. 系统识别的复杂性：C …