Featured image of post 地球CNPS元素循环功能基因数据库

Introduction

生物地球化学循环是维持地球生命系统稳定的基础,其中微生物群落通过代谢活动驱动碳固定与释放、氮转化、磷活化、硫氧化还原及甲烷产生与消耗等关键过程。随着高通量测序技术的普及,宏基因组学已成为研究环境微生物功能多样性的主要手段。然而,现有通用型同源基因数据库存在功能注释模糊、特定循环基因覆盖不全、同源序列干扰等问题,难以满足元素循环研究的精准需求。 针对这一挑战,研究人员系统性地构建了CNPS与甲烷循环功能基因数据库系列,包括NCycDB(氮循环)、PCycDB(磷循环)及相应的碳、硫、甲烷循环数据库。这些数据库采用统一的高标准构建框架,通过人工审校、多数据库整合、同源序列控制等技术,显著提升了功能基因注释的准确性 …