Featured image of post 宏基因组分箱(binning)|3. BASALT优化binning流程

Introduction

在微生物组学研究中,基因组binning(分箱,即将测序数据中的reads或contigs分类到不同的基因组中)是一个关键步骤。发表于2018年的MetaWRAP一直没有重大更新,这篇文章将介绍一个较新的binning流程:BASALT及其具体使用方法。

BASALT (Binning Across a Series of AssembLies Toolkit)是一个高效的基因组binning工具,旨在处理复杂的微生物组数据,特别是在多个组装(assemblies)之间进行binning时表现出色。它通过整合多个组装结果,提高了binning的准确性和完整性,尤其适用于处理高度复杂的微生物群落数据。

BASALT的文章于2024年发表于Nature Communications,软件主页:<a class=“link” href=“https://github.co